Wii nunchuk-controlleren er en sekundær controller, der tilføjer endnu mere innovation til den næste generation af spil, og gør det hele med mindre fysisk bevægelse. Den bruges sammen med den almindelige wii-fjernbetjening, men visse spil har brug for nunchuk-controlleren for at få flere kontrolmuligheder. Nunchuk-controlleren har en form, der passer perfekt til spillerens hånd, og den bygger videre på wii-fjernbetjeningens enkelhed. Nunchuk indeholder den samme tre-aksede bevægelsessensor, som findes i wii-fjernbetjeningen, men har også en analog pind og to knapper til at hjælpe med at bevæge figuren. I mange spil kan du styre din figurs bevægelser med nunchuk i din venstre hånd, mens din højre hånd er fri til at udføre bevægelserne med wii-fjernbetjeningen. Nunchuk'en er f.Eks. Særlig nyttig i spil som wii boxing. Du kan bruge nunchuk til at slå med din svagere hånd, mens du bruger wii-fjernbetjeningen til at slå og jabbe med din dominerende hånd. I first-person shooters bærer nunchuk-controlleren bevægelsesbyrden, så du kan sigte og skyde med en mere naturlig bevægelse med wii-fjernbetjeningen. I et fodboldspil kan du gøre din quarterback flygtig med nunchuk-controlleren, mens du leder efter en åben modtager at kaste til med wii-fjernbetjeningen. Seriøse spillere vil måske endda bruge to nunchuk-controllere for at få en skarp konkurrencefordel. Da wii-fjernbetjeningen og nunchuk-kontrollerne kun er relativt afhængige af hinanden, kan spillerne frit holde dem i den hånd...